De Jonge Seun legt aan bij 3 steigers in de haven:

- Willemskade: bij het nieuwe badhuis aan het einde van de multifunctionele steiger
- Zuiderpier: naast de potvisfontein
- Sassteiger: bij de promenade en station Harlingen Haven
Passagiers kunnen van elke steiger naar elke steiger wanneer de pontvlag daar wappert.
Is de Jonge Seun niet in zicht tijdens diensturen dan staat op de informatieborden bij de steigers het telefoonnummer waarop de schippers te bereiken zijn.
